События фильма происходят по прошествии двух лет после истории Full Metal Alchemist [TV].
Переместившись из своего родного мира в наш мир (1923 год), Эдуардо Элрик живет в Мюнхене, Германия. Лишившись силы алхимика, он тратит все время на исследование ракетной техники вместе с Альфонсо Хедрич (человеком, поразительно схожим с его братом).
Не только Альфонсо Хедрич, но другие люди, которых встречает Эдуардо, кажутся ему знакомыми, вследствие того, что наш мир является параллельным родному миру Эдуардо.
После того как Эдуардо помогает цыганской девушки, он проноситься через череду событий, не только помогающих ему открыть путь домой, но также раскрыть заговор, который может принести серьезные последствия обоим мирам.
В свою очередь Альфонсо Элрик делает ставку на серьезном изучении алхимии, чтобы найти путь для воссоединения со своим старшим братом
«Завоеватель Шамбалы» – отличный подарок всем тем, кто хоть раз видел «Стального Алхимика».
Фильм развивает идеи, заложенные в сериале, и позволяет по-новому взглянуть на вопросы алхимии и жизни.
Это продолжение истории двух братьев, удивительно преданных друг другу и стремящихся быть вместе, а уж в каком из миров – не суть важно.
Родным миром для них становится тот, где есть общее дело и одна дорога на двоих.